Eduardo Naranjo mantiene una estrecha relación con el Museo de Bellas Artes de Badajoz (MUBA), destacando tanto por su presencia en la colección permanente como por exposiciones individuales.
El MUBA alberga varias obras de Naranjo, especialmente en su faceta como grabador. Destaca la serie La Creación, compuesta por siete grabados que representan su visión personal del Génesis bíblico. Estos grabados son técnicamente complejos, utilizando múltiples planchas para lograr patrones de color y calidades que reflejan su virtuosismo. Otras obras en la colección incluyen El sueño, El ensueño o la ensoñación y Sueños blancos, un retrato de Taciana Fisac .
En enero de 2020, el MUBA inauguró la exposición El lugar de la figura, coincidiendo con el centenario del museo. La muestra presentó 31 obras, en su mayoría pertenecientes a la colección privada de Naranjo, creadas en las dos últimas décadas. Estas obras reflejan un realismo detallado y una mirada íntima, incluyendo retratos de su nieta, paisajes de su Monesterio natal y escenas cotidianas .
La exposición fue un éxito de público, convirtiéndose en una de las más visitadas del museo. Naranjo expresó su deseo de que estas obras permanezcan en una colección pública, considerando la posibilidad de que formen parte de una futura fundación o museo dedicado a su obra .
